Reina Aharen, uma estudante pequena e fofa com uma voz tranquila, é muito ruim em determinar distância e espaço pessoal. Às vezes ela está a centímetros de distância do seu rosto, e outras vezes, longe demais! O único que tenta entender suas travessuras é Raidou Matsuboshi, que está sentado ao seu lado na classe. Ele tem um rosto ameaçador, mas na realidade é um garoto gentil com uma imaginação que pode ser meio doidona às vezes. Aharen-san wa Hakarenai segue o par peculiar quando sua estranha amizade começa a florescer quando Raidou pega a borracha de Aharen para ela. Ela interpreta mal seu gesto e agora acredita que eles são melhores amigos, mostrando como a mais simples das coisas pode ser o mais complicado dos desafios para esses dois excêntricos estudantes.
