O Sistema Mizuhanome é um desenvolvimento altamente avançado que permite que as pessoas entrem em um dos lugares mais intrigantes existentes — a mente humana. Através do uso das chamadas “partículas de cognição” deixadas para trás na cena do crime pelo autor, detetives do esquadrão policial especializado Kura podem manifestar a mente inconsciente de um criminoso como um fluxo bizarro de pensamentos em um mundo virtual. Sua tarefa é explorar esse plano psicológico, chamado de “id well”, para revelar a identidade do culpado.
Não qualquer um pode entrar nos poços de id; o pré-requisito é que você deve ter matado alguém você mesmo. É o caso do ex-detetive Akihito Narihisago, conhecido como “Sakaido” dentro dos poços de id. Uma vez um membro respeitado da polícia, a tragédia aconteceu, e ele logo se viu do outro lado da lei.
No entanto, Narihisago continua ajudando Kura no confinamento.
Embora suas prodigiosas habilidades de detetive ainda se revelem úteis para as investigações, Narihisago descobre que nem tudo é o que parece, já que por trás da série aparentemente independente de casos de assassinato espreita uma verdade muito mais sinistra.
