Os Shamans são indivíduos extraordinários com a capacidade de se comunicar com fantasmas, espíritos e deuses, que são invisíveis para as pessoas comuns. A Luta do Shaman, um torneio de prestígio que coloca xamãs de todo o mundo uns contra os outros, é realizada a cada quinhentos anos, onde O vencedor é coroado Xamã Rei. Este título permite ao atual ocupante invocar o Grande Espírito e moldar o mundo como achar melhor.
Certa noite, encontrando-se atrasado para a aula, Manta Oyamada, um estudante comum do ensino médio, decide pegar um atalho pelo cemitério local. Ao vê-lo, um menino solitário sentado em uma lápide convida Manta a contemplar “eles”.
Percebendo que “eles” refere-se ao menino e seus amigos fantasmagóricos, Manta foge do terror. Mais tarde, o menino se apresenta como You Asakura, um Xamã em treinamento, e demonstra seus poderes ao se unir ao fantasma de 600 anos, O velho samurai Amidamaru para salvar Manta de um grupo de bandidos. You se torna amigo de Manta devido à sua habilidade de ver espíritos e, com a ajuda de Amidamaru, eles se propõem a cumprir o objetivo de You de se tornar o próximo Rei Xamã.