Há rumores de que se uma jovem fizer um acordo com uma fada branca, ela concederá qualquer desejo que seu coração deseje. No entanto, em troca, ela se tornará uma garota mágica e deve colocar sua vida em risco para matar bruxas temíveis e ferozes. Iroha Tamaki, uma bondosa estudante de ensino médio da cidade de Takarazaki, é a prova viva de que esses rumores são verdadeiros.
Armado com uma besta mágica e a habilidade de curar lesões, Iroha procura os labirintos onde as bruxas se escondem e as derrotam antes que possam caçar humanos. No entanto, Iroha não se lembra de seu desejo, e mesmo Kyuubey, a fada branca em pessoa, parece não ter ideia do que Iroha pediu dele.
Um dia, Iroha ouve rumores de uma cidade onde “garotas mágicas podem ser salvas”, e encontra-se em um trem ao pôr do sol para a cidade de Kamihama.
Infelizmente, ela descobre que as bruxas em Kamihama são muito mais poderosas do que o normal. Depois que a veterana garota mágica Yachiyo Nanami é forçada a salvá-la, Iroha promete nunca mais voltar. Mas quando um encontro casual com um pequeno Kyuubey parece desencadear memórias distantes, Iroha é obrigado a investigar a misteriosa cidade apesar do perigo.